南通大學杏林學院前身為南通醫(yī)學院杏林學院，始建于1999年2月，是江蘇省首批按新機制、新模式設置的本科層次國有民辦二級學院，2004年5月在南通醫(yī)學院、南通工學院和南通師范學院三家組建合并南通大學后，學院更名為南通大學杏林學院，于2005年5月經教育部批準轉辦為獨立學院。
南通大學杏林學院比較好的專業(yè)有：
自動化、機械工程及自動化、計算機科學與技術、漢語言文學、電子信息工程、統(tǒng)計學、臨床醫(yī)學、行政管理。
南通大學杏林學院招生的專業(yè)有：
自動化專業(yè)
機械工程及自動化專業(yè)
計算機科學與技術專業(yè)
漢語言文學專業(yè)
電子信息工程專業(yè)
統(tǒng)計學專業(yè)
臨床醫(yī)學專業(yè)
行政管理專業(yè)
輕化工程專業(yè)
市場營銷專業(yè)
醫(yī)學檢驗專業(yè)
集成電路設計與集成系統(tǒng)專業(yè)
服裝設計與工程專業(yè)
土木工程專業(yè)
紡織工程專業(yè)
護理學專業(yè)
資源環(huán)境與城鄉(xiāng)規(guī)劃管理專業(yè)
化學工程與工藝專業(yè)
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