學校前身是成立于1951年的山東省昌濰醫士學校，1958年擴建為昌濰醫學院，1987年更名為濰坊醫學院。1986年經國務院學位委員會批準成為全國第三批碩士學位授予單位。自2002年起，學校與山東大學、南方醫科大學、華中科技大學等聯合培養博士研究生。
學校現有15個教學部、系（院），設有16個本科專業，其中臨床醫學、公共事業管理專業是全國高等學校專業，臨床醫學專業、公共事業管理專業、麻醉學專業是山東省高等學校專業，護理學專業為山東省高等學校品牌專業，公共事業管理專業是山東省教學改革試點專業。有24個碩士學位授權學科。人體解剖與組織胚胎學是山東拾泰山學者”設崗學科，分子影像學為濰坊市“鳶都學者”設崗學科，人體解剖與組織胚胎學、影像醫學與核醫學、外科學、眼科學、口腔醫學是山東省省級重點學科，免疫學實驗室、應用藥理學實驗室是山東省省級重點實驗室，整形外科學、眼科學是山東省學科帶頭人設崗學科，眼科學、肛腸外科學是山東省醫藥衛生重點學科。學校是同等學力人員在職申請碩士學位和臨床醫學碩士專業學位授予單位、山東省高等教育自學考試護理學專業（獨立本科段）主考院校、中國漢語水考試（HSK）考點。山東省醫學科技教育中心、山東省基層衛生管理干部培訓中心設在學校。
學校始終堅持教學工作的中心地位，不斷深化教育教學改革，注重提高教學質量。基礎醫學實驗教學中心是山東省普通高等學校實驗教學示范中心；人體解剖學、醫學倫理學、病理學、生理學、組織學與胚胎學、藥理學、醫學影像學、護理管理學8門課程是山東省省級精品課程；醫學心理學、醫學倫理學是山東省教學改革試點課程。5年來，學校先后承擔省級以上教學研究課題90項，獲省級教學成果、實驗教學成果、優秀調研成果獎勵24項。
5年來，學校先后承擔科技計劃項目344項，其中，國家自然科學基金課題7項，省部級課題38項，廳局級課題162項；獲省部級、廳局級科技成果獎勵153項；公開發表學術論文
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